2019
biológia
Sánta Anna
A Shank fehérjecsalád PDZ doménjének kísérletes előállítása és vizsgálata
Témavezető:
Dr. Gáspári Zoltán, Dr. Péterfia Bálint
Összefoglaló
Dolgozatom témája a Shank fehérjecsalád, ezen belül annak PDZ doménje, amely a szinaptikus jelátvitelben játszik szerepet. A fehérjecsalád három tagja mind a posztszinaptikus denzitásban lokalizálódik, és állványfehérjeként számos fontos PSD fehérjével lép interakcióba. Ezen kívül önmagával való interakciói is ismertek. Funkcióvesztéses mutációit összefüggésbe hozták az autizmus spektrum zavar tüneteivel, ami motivációt jelent további kutatására. A Shank fehérjék PDZ doménjével már korábbi dolgozataimban is foglalkoztam tanulmányaim során, így ebben a munkában ezeket a korábbi, és az azóta produkált eredményeket foglaltam össze. A fehérjecsaláddal kapcsolatban már a kísérletes munka kezdetét megelőzően végeztem átfogó irodalomkutatást, amelyet idén felfrissítettem, és kiegészítettem az azóta rendelkezésre álló újabb irodalommal, melyet a dolgozatban mind összefoglaltam. Bioinformatikai eszközök segítségével prediktáltam és terveztem az előállítandó DNS- és fehérjekonstrukciók tulajdonságait. Munkám fő célja a tervezett fehérjekonstrukciók előállítása volt, NMR mérések végzésére alkalmas tisztaságban és koncentrációban. E cél elérése érdekében a félév során számos optimalizálási kísérletet végeztem, melyek segítségével következtetéseket vontam le a rendelkezésre álló eszközök alkalmazhatóságáról. A félévben sikeresen felállítottam egy fehérjetermelési és tisztítási protokollt az egyik Shank1 PDZ konstrukcióhoz. Az általam előállított mintáról NMR méréseket végeztek, amelynek eredményeiből arra következtettem, hogy a fehérje felvette a szerkezetét. Így a fehérjekonstrukció előállítása sikeresnek könyvelhető el, habár a vártnál alacsonyabb koncentrációban. A jövőben a felállított protokollal ezt a folyamatot megismételhetem, több figyelmet fordítva a koncentráció javítására, ami megkönnyítené a további mérések elvégzését. Dolgozatomban ezen kísérletes munka lépéseit és eredményeit mutatom be nagyobb részletességgel.

Sánta Anna
Sánta Anna
Adatok feltöltés alatt
Curriculum Vitae
Karinthy Frigyes Két Tanítási Nyelvű Gimnázium
BSc, molekuláris bionika, PPKE ITK. Szakdolgozat címe: A humán Shank fehérjecsalád bioinformatikai és kísérletes vizsgálata (2017)
MSc, orvosi biotechnológia, PPKE ITK. Diplomamunka címe: A Shank fehérjecsalád szerkezeti működésének bioinformatikai és kísérletes vizsgálata (2019)
Szakmai gyakorlat, Oncompass Medicine Kft. Téma: Új-generációs szekvenálási adatok feldolgozása rákdiagnosztikában (2018)
Phd hallgató, Roska Tamás Műszaki és Természettudományi Doktori Iskola, PPKE ITK. 2019-
Dr. Gáspári Zoltán
Dr. Gáspári Zoltán
Okleveles biológus, ELTE, 1999.
PhD, Szerkezeti biológia, ELTE, 2004.
Tanársegéd, ELTE TTK KI, 2004-2007.
Adjunktus, ELTE TTK KI, 2008-2011.
Docens, PPKE ITK, 2011-
Dr. Péterfia Bálint
Dr. Péterfia Bálint
MSc Biológus, ELTE, 2005.
PPKE ITK, laborvezető, tudományos főmunkatárs 2015-
MTA-TTK, tudományos munkatárs, 2014-2015.
MTA-SE, II. sz. Belgyógyászati Klinika, 2012-2014.
PhD, Általános Orvostudományok, Onkológia, SE-MTA, I. sz. Pat. 2013.
SE, I. sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, tudományos segédmunkatárs, 2009-2012.