2021
informatika
Dinamikus kompartmentális modellek analízise és szimulációja
Témavezető:
Dr. Szederkényi Gábor, Vághy Mihály András
Dr. Szederkényi Gábor, Vághy Mihály András
Összefoglaló
A tömeghatású kinetikát kémiai rendszerek dinamikájának leírására is használják, úgynevezett kémiai reakcióhálózatok (CRN) keretében. A CRN-ek kinetikus egyenleteinek nemnegatív a megoldása, ha a kezdeti feltételben meghatározott érték is nemnegatív, és tudjuk, hogy az egyenletek bizonyos hálózati struktúrák esetén rendkívül robosztusan stabilak.
Kiegészítve azzal, hogy nem csak kémcsövekben lezajló zárt reakciókat, hanem általánosabb szituációkat is modellezhetünk, olyan esetekre is felírhatóvá és használhatóvá válik a modell, mint például a biokémiai folyamatok.
Az összetettebb biokémiai folyamatok modellezésére nem elég a zárt CRN modell. Ahhoz, hogy legyen ki-, és bemenete egy kinetikus rendszernek, ki kell egészíteni a modellt egy megfelelő kompartmentális alakra (Traffic Reaction Modell, TRM). A forgalomáramlási modellek és a kinetikai elmélet áthidalásának előnyei a megőrzéstől, az egyensúly és a pályák szerkezetétől, a stabilitástól és egyebekig terjednek.
Kiegészítve azzal, hogy nem csak kémcsövekben lezajló zárt reakciókat, hanem általánosabb szituációkat is modellezhetünk, olyan esetekre is felírhatóvá és használhatóvá válik a modell, mint például a biokémiai folyamatok.
Az összetettebb biokémiai folyamatok modellezésére nem elég a zárt CRN modell. Ahhoz, hogy legyen ki-, és bemenete egy kinetikus rendszernek, ki kell egészíteni a modellt egy megfelelő kompartmentális alakra (Traffic Reaction Modell, TRM). A forgalomáramlási modellek és a kinetikai elmélet áthidalásának előnyei a megőrzéstől, az egyensúly és a pályák szerkezetétől, a stabilitástól és egyebekig terjednek.
Dr. Szederkényi Gábor
Vághy Mihály András